Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SrprbP47758 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SrprbP47758 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SrprbP47758 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SrprbP47758 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SrprbP47758 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SrprbP47758 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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