Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rab11bP46638 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms