Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms