Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms