Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa2P31245 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms