Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VtnP29788 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VtnP29788 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms