Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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