Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Pde6aP27664 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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