Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl3P27659 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms