Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Myf5P24699 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myf5P24699 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myf5P24699 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myf5P24699 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myf5P24699 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myf5P24699 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myf5P24699 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Myf5P24699 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myf5P24699 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Myf5P24699 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms