Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms