Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NelfeP19426 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NelfeP19426 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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