Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18524 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms