Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms