Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm2707-201ENSMUST00000188979 714 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms