Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms