Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Kpna3O35344 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kpna3O35344 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kpna3O35344 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Kpna3O35344 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kpna3O35344 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kpna3O35344 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kpna3O35344 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kpna3O35344 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kpna3O35344 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kpna3O35344 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms