Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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H2-Q1O19441 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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H2-Q1O19441 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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H2-Q1O19441 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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H2-Q1O19441 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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H2-Q1O19441 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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H2-Q1O19441 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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