Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casq1O09165 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casq1O09165 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms