Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms