Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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