Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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H2-M1F7CXU4 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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H2-M1F7CXU4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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H2-M1F7CXU4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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H2-M1F7CXU4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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H2-M1F7CXU4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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H2-M1F7CXU4 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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H2-M1F7CXU4 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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H2-M1F7CXU4 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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H2-M1F7CXU4 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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H2-M1F7CXU4 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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