Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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