Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms