Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc1E9Q043 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms