Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms