Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Clrn2B2RVW2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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