Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 2610020F03Rik-201ENSMUST00000180401 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 4933417G07Rik-201ENSMUST00000199681 1137 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Hnmt-203ENSMUST00000114498 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr29B1ARI9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms