Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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PtprsB0V2N1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms