Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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