Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrfQ9JM73 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrfQ9JM73 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrfQ9JM73 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrfQ9JM73 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrfQ9JM73 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrfQ9JM73 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrfQ9JM73 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrfQ9JM73 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrfQ9JM73 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrfQ9JM73 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrfQ9JM73 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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