Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms