Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PmpcaQ9DC61 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms