Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms