Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Trim13Q9CYB0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim13Q9CYB0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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