Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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