Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 426.2 ms