Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atg3Q9CPX6 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg3Q9CPX6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms