Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms