Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms