Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ciao1Q99KN2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ciao1Q99KN2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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