Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn2aQ99KJ0 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms