Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Hps4Q99KG7 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Hps4Q99KG7 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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