Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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