Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms