Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1aQ8VDS4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1aQ8VDS4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1aQ8VDS4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1aQ8VDS4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1aQ8VDS4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1aQ8VDS4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1aQ8VDS4 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1aQ8VDS4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1aQ8VDS4 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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