Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms