Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Abcf3Q8K268 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Abcf3Q8K268 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Abcf3Q8K268 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Abcf3Q8K268 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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