Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms