Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV2

Tph2, Tryptophan 5-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph2Q8CGV2 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tph2Q8CGV2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tph2Q8CGV2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Tph2Q8CGV2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Tph2Q8CGV2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Tph2Q8CGV2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Tph2Q8CGV2 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Tph2Q8CGV2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Tph2Q8CGV2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Tph2Q8CGV2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tph2Q8CGV2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms